Aprile. Arato, studente del secondo anno di liceo, aveva una vita normale che trascorreva con i suoi amici Ryo e Kengo. Fino a quella sera. Mentre torna a casa dopo aver fatto la spesa, Arato viene attaccato da un hIE corrotto, ma una bellissima hIE di nome Lacia arriva in suo soccorso.

Dopo aver firmato un contratto con Arato, Lacia è venuta a vivere con gli Endo. Yuka, la sorella di Arato, ha accettato completamente Lacia e l'ha persino iscritta a un'audizione per modelle di HIE. Nel frattempo, Arato non riesce a nascondere la sua apprensione per la convivenza con una ragazza che sembra avere la sua stessa età.

Nonostante la consapevolezza dell'hacking analogico, Arato non può fare a meno di essere attratto da Lacia. In mezzo a tutto questo, Lacia viene "rapita" proprio davanti a Yuka. Arato è arrabbiato con la polizia e con la sua riluttanza a trattare questo caso come qualcosa di diverso dal furto di proprietà, così chiede l'aiuto di Ryo e Kengo per indagare da soli.

Kouka, la violenta hIE che si definisce la prima sorella di Lacia. Grazie al suo controllo sulla rete di anticorpi, sta progettando di compiere un terribile atto di terrorismo. Quando Arato viene a sapere che il suo piano sta mettendo in pericolo Kengo, si mette in viaggio per salvare Kengo con l'aiuto di Lacia.

Arato arriva al centro di promozione industriale che è l'obiettivo dell'attacco terroristico della rete anticorpi. Salendo le scale, vede l'androide politico Mikoto sviluppato da suo padre, che lo mette a disagio. Poco dopo, l'unità terroristica guidata da Kouka e un altro HIE di classe Lacia arrivano sulla scena. Sta per scoppiare una grande battaglia!

Arato riesce a salvare Kengo dalla calamità del centro di promozione industriale. Tuttavia, anche dopo essere tornato alla vita normale, si ritrova consumato da misteri sempre più profondi. Nel frattempo, alla Memeframe Corporation si inasprisce una disputa tra fazioni. In questo contesto, la hIE Methode di classe Lacia sta per fare la sua mossa.

Lacia ha un nuovo lavoro come modella. Si tratta di uno spot pubblicitario per promuovere un nuovo tipo di relazione tra gli hIE e gli esseri umani, in cui le persone vedono gli hIE di sesso opposto come un partner alla pari.

Metode, dopo aver stretto un accordo con Shiori, ha lanciato un attacco a sorpresa contro Reisha durante le riprese di uno spot pubblicitario. La situazione che coinvolgeva Arato e Reisha era destinata a cambiare radicalmente ancora una volta. In mezzo a questo tumulto, una studentessa trasferitasi da un'altra scuola è arrivata al liceo di Arato. Erika Barrows, risvegliata dal sonno criogenico, una “bella addormentata” nata nel XXI secolo. Arato si è trovato di fronte a una strana ostilità da parte di Erika.

Il piano di Shiori aveva iniziato a prendere forma. Se le cose fossero continuate così, Arato avrebbe perso la proprietà di Reisha. “Arato-san... ti prego, lasciami stare con te.” Commosso dalle parole inaspettate di Reisha, Arato partì per l'aeroporto internazionale Chubu Centrair, determinato a fermare Shiori e gli altri.