A bordo del modulo 77 della JIOR Sphere 01, Haruto Tokishima perde una gara gastronomica contro Shōko Sashinami per l'uso del cortile della scuola mentre a loro insaputa, cinque agenti Dorssian sotto copertura si infiltrano nella Sakimori High School. Qualche tempo dopo, mentre gli agenti esplorano la scuola in cerca di una destinazione, uno di loro ha un breve alterco con Haruto sulle loro diverse visioni del mondo. Successivamente, gli agenti Dorssian si infiltrano e uccidono gli scienziati in un laboratorio segreto sotto la scuola, anche se uno scienziato ferito espelle il loro obiettivo principale, un gigantesco mecha chiamato Valvrave 01 sulla superficie della scuola.

Kyūma Inuzuka, Aina Sakurai e Saki Rukino arrivano nella posizione di Valvrave per trovare un Haruto e L-elfo privi di sensi. All'arrivo degli altri agenti Dorssian, L-elfo tradisce i suoi compagni e aiuta gli studenti a fuggire. Successivamente, mentre le forze Dorssiane occupano il Modulo 77, Haruto convince i suoi amici di aver in qualche modo posseduto il corpo di L-elfo e in seguito riprende la Valvrave, riuscendo anche a tornare nel proprio corpo con l'aiuto di Saki. Quando la Valvrave si attiva e attacca la vicina nave Dorsiana, si ritrova sbalzata fuori dal Modulo nello spazio. A-drei e Q-vier usano quindi i Dorssia Ideal Mech per attaccare il Valvrave 01 credendo che L-elfo li abbia traditi.

Le forze dell'ARUS catturano L-elfo mentre trasmette una strana stringa di parole ad Haruto. Mentre le forze dell'ARUS insieme al senatore Figaro forniscono sollievo agli studenti dell'Accademia Sakimori, Haruto ei suoi amici cercano di dedurre la natura delle sue nuove abilità senza riuscirci. In seguito, Figaro invia la parola per incontrare Haruto e lo esorta a diventare un simbolo di speranza nella guerra contro Dorssia. Nel frattempo, mentre L-elfo fugge dalla sua prigionia, Cain invia A-drei, X-eins, H-neun e Q-vier in un altro tentativo di riconquistare il Modulo 77.

Il presidente Jeffrey Anderson e il senato ARUS votano per ottenere l'arma JIOR Valvrave per aiutare nella loro campagna contro Dorssia. Nel frattempo, dopo aver rifiutato il contratto di L-elfo, Haruto non riesce a impedire a Figaro di sperimentare con l'Unità 01, provocando la morte di un pilota ARUS. La flotta Dorssian effettua quindi un attacco iniziale contro il Modulo 77 che spinge Figaro a dare la priorità alla sua sicurezza rispetto agli studenti Sakimori in una trasmissione intercettata da Shōko e Akira Renbōkoji. Shōko usa quindi mezzi drastici per informare il Consiglio studentesco del tradimento di Figaro e mentre Takahi Ninomiya distrae i rappresentanti dell'ARUS, Shōko, Kyūma e Yūsuke Otamaya salvano Haruto. Mentre Figaro tenta di andarsene, appare Haruto e rivela le sue vere intenzioni al corpo studentesco incredulo. Avendo perso la pazienza, Figaro inizia a sparare sugli studenti finché Haruto non lo ferma con l'Unità 01.

Con il loro ricatto che tiene a bada le forze ARUS e Dorssiane, gli studenti Sakimori godono di una pace fuori luogo a bordo del Modulo 77, anche se ignari del suo consumo di energia pericolosamente elevato. Altrove, Dorssian Führer Amadeus K. Dorssia raduna le sue forze insieme a una dimostrazione di potere. Durante l'esplorazione delle profondità del Modulo 77, L-elfo fa una scoperta quando la rete elettrica si interrompe a causa del sistema meteorologico sovraccarico. Nonostante sia rinchiuso nell'hangar Valvrave 01, Takumi Kibukawa spiega il problema con Yusuke che è l'unica altra persona da comprendere. Raizō quindi trascina Yūsuke alle altezze del Modulo per ripristinare il sistema, trovando infine l'interruttore quando quest'ultimo cade attraverso il pavimento danneggiato dalla battaglia. Il clima freddo inizia anche a smorzare gli spiriti delle ragazze Sakimori al punto che Takahi e la sua cricca iniziano ad attribuire la colpa a Shōko e Saki.

Nonostante il tentativo di Haruto di fermarla, Saki sale a bordo del Valvrave Four e con sua sorpresa completa con successo la sua procedura di avvio. Osservando segretamente il successo di Saki nel pilotare il Valvrave Four, L-elf deduce che la struttura sotterranea non è stata costruita per caso sotto la Sakimori High poiché gli studenti soddisfano alcuni requisiti per azionare i mech confrontandoli con il tentativo fallito del soldato ARUS. Dopo un po' di gioia, Saki si lamenta del suo passato, facendo abbassare la guardia ad Haruto e lei lo morde, cambiando la loro coscienza. Successivamente Haruto (Saki) usa l'account WIRED di Haruto per aumentare la propria popolarità come idolo. Quando viene confrontata da Haruto, e subito dopo da Shōko, afferma che se non afferma il suo status di idolo, tutti si dimenticheranno di lei.