くるみは、寿退職目前ののんきな婦警。ある日、ウエディングドレスを選んでいたホテルで殺人事件に遭遇する。程なくくるみは、なぜか警視・光三郎の配下、通称「A別館」に転属に。地下室に引きこもる光三郎は、彼女の携帯電話に無茶な指令を送り続ける。くるみは腹を立てながらも、記憶と指令を頼りに被害者のMOディスクを入手。光三郎がディスクを開くと、中には次の殺人予告が入っていた。

“犯人”のピエロが車に轢かれて死亡し、一件落着と思われたピエロ連続殺人事件――。だが、くるみがマネキン工房で拾ったMOの中を見た氷室光三郎は、事件がまだ継続中だと気付いた。MOの画面に出てきたのは、『Ｎ』と『Ｅ』の字が記された２つのパスワードの空欄、そして、バウムクーヘンの映像。光三郎は、これが第４の殺人の予告だと確信した。

渋谷にある高校・松濤学院の生徒がよく利用するカフェに、爆弾が仕掛けられる騒ぎがあった。最近、“松濤学院の校長の元に爆弾魔から脅迫状が届いている”との内部告発の手紙を受け取っていた光三郎は、犯人が学院に恨みを持つ人物だとにらむ。ところが、最近、松濤学院の校内で生徒の自殺があったらしく、校長の高森は、話を聞きに行ったくるみに非協力的だった。

爆弾魔に占拠された松濤学院は、校長の高森が爆殺されたことでパニック状態になった。恐怖感にかられた生徒たちは、犯人の指示に従って圭輔狩りに動き出す。直美は、目の色を変える生徒たちをたしなめるが、興奮は収まりそうにない。ケガをした生徒を連れてきた教師の絵馬ですら恐ろしさを顔ににじませた。

大手消費者金融・フラバローンの店舗で、連続して窃盗事件が発生した。氷室の指示で、くるみは、金庫破りのプロに扮し、窃盗団に接触。仲間のふりをして、裏で窃盗団を操る黒幕を探る。窃盗に参加したくるみは、やけに店舗内の警報装置に詳しい立石に疑念を抱きつつも、初めての金庫破りに挑戦。氷室のサポートで、無事やり遂げる。仕事に成功し、メンバー全員で祝杯をあげる。だが、翌日侵入した店舗で、フラバローン社長・村西の死体が見つかる。

くるみは大財閥の跡継ぎ・真一を警護することになった。婚約披露パーティーを控えた真一は、何者かに脅迫されているという。くるみは、スケベな真一に腹を立てながら渋々仕事に就く。そこへ真一あてに小包が届き、中から毒ヘビがはいだす。氷室の指示で、くるみたちはなんとか危機を回避。一方、氷室は回収した毒へビに違和感を抱く。

米・ボストン市警のマイコらが環七署にやってきた。来日したボリス大統領を警護するためだという。氷室に暗殺者逮捕を命じられたくるみは容疑者がボブと聞き愕然。半信半疑のまま、大統領の歓迎イベントを迎える。予想どおり、大統領は狙撃されるが失敗。混乱の中、くるみはボブと対峙する。

伸吾との旅行中、車の故障で立ち往生していたくるみは、大学生の花蓮と出会う。くるみの位置を知った氷室は逃げるよう指示。近辺では凶悪な殺人鬼が出没していた。花蓮を連れ戻しにきた父親・千曲川も加わるが、交通手段がなく、一行は近くのロッジで一夜を過ごす。そこで奇妙な3人に遭遇する。

氷室の幼なじみ・直美 が「スネイル」と名のる人物に誘拐された。直接、犯行声明を受けた氷室は激しく動揺。くるみは、氷室の取り乱す姿を初めて見る。そんな中、身代金要求の連絡が入る。要求どおりに用意した氷室は、くるみを受け渡しに向かわせる。だが、犯人は受け渡し場所を変える指示を次々と出し、氷室とくるみを追い詰める。

直美を誘拐した犯人・スネイルとの身代金受け渡しに失敗した氷室は、激しく落ち込む。恋人・由香が犠牲になった1年前の事件について聞いたくるみは、氷室を哀れむと同時に強く叱咤。くるみの優しさにふれ、氷室は自分を取り戻す。2人は捜査を再開。くるみは自分の存在まで熟知していたスネイルに疑念を抱く。